[Windows] FlowJo 10.4.0 [x64][Anglais] + [ACTIVATION PATCH]

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RÉSUMÉ

FlowJo est la plateforme d'analyse leader pour traiter les données de cytométrie en flux.

Grâce à une interface intuitive, à des plateformes d'analyse spécialisées et à une architecture modulaire libre de développement, FlowJo propose un environnement d'analyse riche et facile à utiliser, versatile et extensible.

Les espaces de travail (workspaces) FlowJo sont des environnements statistiques puissants couramment utilisés pour le phénotypage immunitaire, l'analyse du cycle cellulaire, les études cinétiques, la comparaison quantitative de populations ou les expériences de screening en plaques, pour ne nommer que ces possibilités.

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FONCTIONNALITÉS

Qu'est-ce que FlowJo ?

- C'est un environnement intégré d'affichage et d'analyse de données de cytométrie en flux
- Analyse uniforme d'expériences (même avec beaucoup d'échantillons)
- Présence d'outils sophistiqués permettant la génération de graphiques et de rapports statistiques, guidant la découverte de mécanismes biologiques


Groupes et analyses de groupes

- La zone "Group" liste tous les groupes dans le workspace, le nombre d'échantillon dans chaque groupe et le rôle de chaque groupe (test, compensation, contrôle, etc.)
- Les groupes agissent comme des dossiers pour organiser vos échantillons et permettent de grouper vos stratégies de gating et d'analyse
- Les analyses de groupes affichent toutes les analyses au sein d'un groupe


Échantillons et analyses d'échantillons

- Affiche la liste des échantillons et les analyses associées à leur groupe
- Les colonnes "Statistic" et "#Cells" sont affichées par défaut, mais d'autres informations peuvent être affichées en colonnes
- Double-cliquez sur un échantillon pour l'ouvrir sous forme de graphique et ajouter des gates


Graphiques

- La fenêtre des graphiques facilite la visualisation des données et le gating
- Différents types de graphiques sont disponibles pour afficher vos données


Options d'affichage des graphiques

- Vous pouvez toutes les essayer et choisir celle qui convient le mieux à vos données : "pseudocolor", "contour", "zebra", "dot" ou "histogram"


Outils de gating

- Sont localisés en haut de chaque fenêtre de graphique
- Les gates peuvent toujours être modifiées ou supprimées, alors ne soyez pas timides
- Explorez les options de gating et choisissez ce qui fonctionne le mieux pour vous


Transformation des données

- Vos données peuvent parfois paraître "étranges" ou "déformées" initialement
- Vous pouvez cliquer sur l'icône de transformation pour changer l'affichage visuel de vos données


Hiérarchie de gating

- Quand vous créez une gate sur un échantillon, FlowJo vous montre cette gate (= cette sous-population contenue dans la gate) comme un arbre généalogique
- Une sous-population est un enfant de l'échantillon parent


L'éditeur de layout

- Un outil pour créer des rapports graphiques
- Simplement glissez et déposez les gates choisies d'un sample vers l'éditeur de layout
- Pareillement au workspace, l'éditeur de layout possède ses propres et personnalisables options pour organiser les actions possibles
- Essayez de cliquer sur les différentes icônes pour voir quels types d'actions sont disponibles
- Les graphiques peuvent être organisés et reformatés
- Des statistiques, des mots-clés, du texte et même des formes géométriques ou des objets peuvent être ajoutés pour illustrer votre analyse
- Nous vous encourageons à explorer tous ces outils pour améliorer la visualisation de vos données


Analyse par lot (batching) de l'éditeur de layout

- Les opérations d'analyse par lot effectuent des analyses répétées sur de multiples échantillons, appliquant le layout créé à tout un ensemble d'échantillons
- Spécifiez sur quel groupe vous voulez batcher votre analyse (par échantillon ou mot-clé par exemple), puis spécifiez où vous voulez que la sortie du batch aille et validez


L'éditeur de tableaux

- Un outil pour créer des rapports statistiques (sous forme de tableaux)
- Simplement glissez et déposez les populations de votre choix dans l'éditeur de tableaux
- De même, l'éditeur de tableaux possède ses propres et personnalisables options pour organiser les actions possibles
- Spécifiez le groupe sur lequel vous voulez batcher, et comment vous voulez itérer le processus de batch, puis spécifiez où vous voulez que la sortie du batch aille et validez


Compensations

- Les compensations corrigent le spillover ("débordement" ou "bavage") entre spectres d'émission des fluorochromes présents dans le panel
- Les compensations sont essentielles pour les panels multicouleurs


L'utilitaire de compensation

- Cet outil gate automatiquement dans vos échantillons de compensation et remplis les contrôles négatifs et positifs


Template de workspace

- Ils vous permettent de sauvegarder vos rapports d'analyse présents dans votre workspace mais sans les données
- Permettent des analyses répétitives en série pour différentes expériences utilisant le même panel de couleurs


FlowJo en ligne de commande

- FlowJo peut être lancé sans interface graphique via la ligne de commande, permettant d'appliquer les templates et générant des rapports automatiques


L'éditeur de plaques

- Visualisation sous forme de plaques pour ajouter des mots-clés 
- Possibilité d'exporter un layout pour utilisation dans le logiciel d'acquisition BD FACS Diva


Analyse du cycle cellulaire

- La plateforme de cycle cellulaire permet la modélisation 1D des phases du cycle cellulaire, basée sur la quantité d'ADN
- En cours de développement, à utiliser avec précaution


Ressources et formations additionnelles

- Des webinars sur les fonctions basiques et avancées de FlowJo sont tenus tous les 1er et 3 du mois
- Le calendrier des webinars peut être trouvé ici : http://www.flowjo.com/webinars/
- Les documentations techniques des versions de FlowJo > 10.0.0 peuvent être trouvées ici : http://docs.flowjo.com/
- Le site "The Daily Dongle" propose des astuces, des trucs et des questions aux questions les plus communes ou non : http://flowjo.typepad.com/

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CONFIGURATIONS SYSTÈMES MINIMALES ET RECOMMANDÉES

Configuration MacOS minimale :

- 2GB de RAM
- Processeur Core II Duo
- OS X 10.6.8
- Apple Java Runtime Environment 6. Disponible sur le lien suivant, sauf sur le navigateur Safari : http://support.apple.com/kb/DL1572

Configuration MacOS recommandée :

- 16GB de RAM
- Processeur Intel i7 quad core

Configuration Windows minimale :

- 2GB de RAM
- Processeur 64 bits dual core
- Windows Vista
- Oracle Java Runtime Environment 6 (déjà intégré à FlowJo)

Configuration Windows recommandée :

- 16GB de RAM
- Processeur Intel i7 quad core
- Windows 10

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INSTALLATION/ACTIVATION

1) Installez FlowJo avec l'installateur officiel "FlowJo-Win64-10.4.0.exe"
2) Copiez le fichier "ActivationCrack.exe" dans le dossier d'installation de FlowJo
3) Lancez le en mode administrateur et cliquez sur "Patch"
4) Vérifiez qu'un message de réussite écrit en vert apparaisse, puis fermez le patcheur
5) Lors du premier lancement de FlowJo, acceptez les conditions d'utilisation et la licence, et assurez-vous bien que la méthode d'activation est "Dongle USB"
6) Validez cette fenêtre
7) Profitez !

DÉTAILS SUR L'UPLOAD

Système d'exploitation supporté : Windows (éditions 64 bits seulement) >= Windows Vista
Taille de l'upload : 140 Mo
Type/nombre des fichiers inclus : fichiers .EXE (x2)
Note : le patcheur fonctionne également sur la toute dernière version de FlowJo 10.4.1 (64 bits) disponible sur le site officiel de FlowJo. Son utilisation provoque un message d'erreur comme quoi ce n'est pas le même fichier à patcher que celui attendu, mais si l'on confirme le patch quand même, cela fonctionne et le logiciel marche malgré tout. Je n'ai pas noté de bugs, mais je n'ai pas tout testé, alors n'hésitez pas à venir commenter pour faire part de votre essai sur la version 10.4.1
Note 2 : il est possible que le patcheur soit détecté par certains antivirus (par exemple Avira), mais il est totalement sain !

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